日本晴/コシヒカリ//コシヒカリ 染色体断片置換系統群 41系統(N/K//K CSSL41系統) 本材料は、日本晴/コシヒカリのF1個体にコシヒカリを戻し交雑して作成した41系統の染色体部分置換系統群です。各系統の遺伝子型は、108個のDNAマーカー(104個のSSRマーカーと4個のSNPマーカー) を使って調べています。 遺伝子型データ PDF(36K) EXCEL(95K) 日本晴のホモ遺伝子型は"A"、コシヒカリのホモ遺伝子型は"B"、ヘテロ遺伝子型は"H"で示されています。 各マーカーの物理位置(ゲノム上のポジション)はIRGSP build 4.0に基づいています。 注)実験系統の作出に用いた日本晴の中で多型を示すDNAマーカーが存在します。そのため、一部の系統については日本晴の遺伝子型をA'と判定しています。 <引用文献> Hori K, Sugimoto K, Nonoue Y, Ono N, Matsubara K, Yamanouchi U, Abe A, Takeuchi Y, Yano M (2010) Detection of quantitative trait loci controlling pre-harvest sprouting resistance by using backcrossed populations of japonica rice cultivars. Theoretical and Applied Genetics 120(8):1547-1557. |
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