日本晴/コシヒカリ//コシヒカリ 戻し交雑自殖系統群 127系統 (N/K//K BIL 127系統)


本材料は、単粒系統法によって作出された日本晴/コシヒカリ//コシヒカリの戻し交雑自殖系統群(127系統)です。各系統の遺伝子型は、111個のDNAマーカー(102個のSSRマーカーと9個のSNPマーカー)を使って調べています。
本材料は、恒久的なマッピング集団として、QTL解析に有効に利用できる研究材料です。

 遺伝子型データ PDF(103K) EXCEL(226K)

日本晴のホモ遺伝子型は"A"、コシヒカリのホモ遺伝子型は"B"、ヘテロ遺伝子型は"H"で示されています。
各マーカーの物理位置(ゲノム上のポジション)はIRGSP build 4.0に基づいています。


<引用文献>
Matsubara K, Kono I, Hori K, Nonoue Y, Ono N, Shomura A, Mizubayashi T,Yamamoto S, Yamanouchi U, Shirasawa K, Nishio T, Yano M (2008) Novel QTLs for photoperiodic flowering revealed by using reciprocal backcross inbredlines from crosses between japonica rice cultivars. Theor. Appl. Genet. 117(6):935-945
(http://dx.doi.org/10.1007/s00122-008-0833-0).


687個のDNAマーカー(49個のSSRマーカーと638個のSNPマーカー)の遺伝子型を追加しました。

 遺伝子型データ PDF(7.9M) EXCEL(387K)

日本晴のホモ遺伝子型は"A"、コシヒカリのホモ遺伝子型は"B"、ヘテロ遺伝子型は"H"で示されています。
各SNPマーカーの物理位置(ゲノム上のポジション)はIRGSP build 4.0に基づいています。

<引用文献>
Hori K, Kataoka T, Miura K, Yamaguchi M, Saka N, Nakahara T, Sunohara Y, Ebana K, Yano M. (2012) Variation in heading date conceals quantitative trait loci for other traits of importance in breeding selection of rice. Breed Sci. 62(3): 223-234.
(https://www.jstage.jst.go.jp/article/jsbbs/62/3/62_223/_article)
| 親品種 | N/K BIL98系統 | N/K CSSL54系統 | A/K DHL212系統 | I/K RIL116系統 |
| K/K BIL182系統 | K/K CSSL39系統 | | |
| K/H//K BIL93系統 | K/N CSSL44系統 | | |
| S/H BIL85系統 | S/H CSSL39系統 | | |
| N/K//K BIL127系統 | N/K//K CSSL41系統 | | |
| N/K//N BIL79系統 | N/K//N CSSL48系統 | | |
| J/K//K BIL95系統 | K/IR//K CSSL42系統 | | |
| | K/IR//IR CSSL40系統 | | |
HOME about RGRC What's New Foreword DNA / Seed Stocks Ordering Procedure Price List Citation Links