イネ完全長cDNA

 イネ完全長cDNAプロジェクト(生物系特定産業技術研究推進機構、農業生物資源研究所、理化学研究所、国際科学振興財団の共同研究)において全長の塩基配列決定された約3万クローンを提供することができます。各クローンの詳細な情報は、KOME(Knowledge-based Oryza Molecular biological Encyclopedia)で公開されています。必要なクローンは、本データベースで検索してお調べ下さい。

イネ完全長cDNAクローンはプラスミドDNAとして配付しています。使われたベクターはpME18SFFL-3(clone ID 001〜, clone ID 006〜), pCMV-SPORT6(clone ID 002〜) and Lambda-FLC(clone ID J0〜, clone ID J1〜)で、各クローンのベクター情報はこちらです。クローン準備の手本はこちらです。

 イネ突然変異系統

突然変異系統は、Tos17ミュータントパネルデータベースで公開しています。本データベースは、イネ内在性レトロトランスポゾンTos17を転移させて作成した遺伝子破壊系統のデータベースです。データベースには、系統ごとの表現型と、破壊された領域の塩基配列が整理されています。興味を持った塩基配列を挿入部位隣接塩基配列に対して検索することで、その遺伝子の破壊系統の有無が判ります。検索結果ページより、対応する系統の表現型データと画像が閲覧できます。同ページより種子の分譲依頼も可能です。なお、アクセスにはユーザー登録が必要です。


 イネ遺伝解析材料

 下記の17種類のイネ遺伝解析材料が利用できます。

 分譲種子粒数は、各系統20粒です。


親品種 9品種
日本晴/Kasalath 戻し交雑自殖系統群
98系統
(N/K BIL98系統)
日本晴/Kasalath 染色体断片置換系統群 54系統 (N/K CSSL54系統)
コシヒカリ/Kasalath 戻し交雑自殖系統群 182系統 (K/K BIL182系統)
コシヒカリ/Kasalath 染色体断片置換系統群 39系統 (K/K CSSL39系統)
コシヒカリ/はやまさり//コシヒカリ 戻し交雑自殖系統群 93系統 (K/H//K BIL93系統)
コシヒカリ/NonaBokra 染色体断片置換系統群 44系統 (K/N CSSL44系統)
ササニシキ/ハバタキ 戻し交雑自殖系統群 85系統 (S/H BIL85系統)
ササニシキ/ハバタキ 染色体断片置換系統群 39系統 (S/H CSSL39系統)
アキヒカリ/コシヒカリ 半数体倍加系統群 212系統 (A/K DHL212系統)
日本晴/コシヒカリ//コシヒカリ 戻し交雑自殖系統群 127系統 (N/K//K BIL127系統)
日本晴/コシヒカリ//日本晴 戻し交雑自殖系統群 79系統 (N/K//N BIL79系統)
日本晴/コシヒカリ//コシヒカリ 染色体断片置換系統群 41系統 (N/K//K CSSL41系統)
日本晴/コシヒカリ//日本晴 染色体断片置換系統群 48系統 (N/K//N CSSL48系統)
Jarjan/コシヒカリ//コシヒカリ 戻し交雑自殖系統群 95系統 (J/K//K BIL95系統)
コシヒカリ/IR64//コシヒカリ 染色体断片置換系統群 42系統 (K/IR//K CSSL42系統)
コシヒカリ/IR64//IR64 染色体断片置換系統群 40系統 (K/IR//IR CSSL40系統)
IR64/Kinandang Patong 組換え近交系統群 116系統 (I/K RIL116系統)


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